1895至1920年，臺灣曾經面臨鼠疫、霍亂、流行性感冒、瘧疾、天花等傳染病大規模的侵襲。其中，鼠疫的流行更與臺灣衛生的開展息息相關。1923年，美國學者文士樂（C. E. A. Winslow）將衛生（由國家負責人民健康）定義為一種預防疾病、延年益壽、促進身心健康與效能的科學與藝術。經由有組織的社會力量，從事環境衛生，以防止疾病傳染，並實施個人衛生教育，發展醫護事業，使疾病得以獲得適當預防及治療，更進而組織社會機構，透過這種方式，以確保各個份子的生活水準，實現國民健康及長壽的要求。

本文首先介紹臺灣衛生體制建立前的風土概況；其次是殖民政府因應傳染病的流行，逐步建立起衛生政策與醫療行政的過程；最後則是鼠疫、霍亂、流行性感冒等三類傳染病於日治時期在臺灣流行的概況、殖民政府的應對方式，以及民眾的觀感。觀照如今新冠肺炎的流行，至10月30日17點為止，感染人數已達4千5百萬，死亡人數為118萬。從過去到現在，人與病菌的戰爭從未停歇。

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