2020年院區開放有鑑於新冠肺炎的流行，本所特以日治時期曾在臺灣爆發大規模流行的鼠疫、霍亂、流行性感冒作為展示主題。精選寫真帖、出版品插圖、明信片、公文書、日記等館藏，回首百年前傳染病橫行之際，島上居民與之對抗的歷程。