自97年度7月至12月止，本所已入藏史料共計28批，將依本所古文書室史料入藏作業程序進行整理與編排，陸續開放應用。史料目錄如下：

1. 南投林衡均家族文書(林衡均捐贈)
2. 南投林衡均家族照片(林衡均捐贈)
3. 嘉義梅山葉家土地文書(嘉義縣文化局提供)
4. 嘉義東石陳蔥文書(嘉義縣文化局提供)
5. 彰化永靖詹一邨詩稿(詹明正提供)
6. 彰化永靖詹一邨家族照片(詹明正提供)
7. 民國47、49年新竹地區人士日記(郭双富捐贈)
8. 民國36年新竹新埔二二八事件相關資料(郭双富捐贈)
9. 民國36年省立臺中圖書館談話室茶會每月定日值東表(郭双富提供)
10. 郭双富集藏照片(郭双富提供)
11. 二水楊氏家族土地文書(楊朝傑提供)
12. 嘉義義竹翁家族譜(林玉茹採集)
13. 大正3、4年歷史寫真(楊麗祝提供)
14. 新竹湖口黃氏家族土地文書(黃仁灶提供)
15. 新竹湖口黃氏家族照片(黃仁灶提供)
16. 臺中東勢吳家土地文書(林鑫咸提供)
17. 臺南七股一帶魚塭帳簿(本所購藏)
18. 淡水街長小副川猛檔案(本所購藏)
19. 臺中梧棲陳明貴家族照片(陳振邦提供)
20. 臺中梧棲陳家族族譜(陳振邦提供)
21. 臺中梧棲呂金梭回憶錄(王森哲提供)
22. 臺中紀有泉照片(紀藝林提供)
23. 岡本要八郎相關資料(周明德提供)
24. 新埔蔡家文書(本所購藏)
25. 林場相關檔案(本所購藏)
26. 製茶法講義(本所購藏)
27. 民國37至38年菸酒申請配給文書(本所購藏)
28. 嘉義義竹翁家文書(本所購藏)